奶豆腐和豆腐一樣在適宜的溫度才能保留其風味，如果放在溫度較高的地方，可能會變餿。一般將奶豆腐放在冰箱中冷藏是可以的，超市裏的奶酪都是放在開放的冷凍箱裏，避免其變質。保存奶豆腐，溫度不宜過高或過低，溫度過高變餿是必然的，而溫度過低奶豆腐就會結成冰塊，這樣可能是影響其口感。奶豆腐還是早吃爲好，而且要密封冷藏，在兩個星期內吃完是最好的。
如果不嫌麻煩，也可以先切小塊然後刨絲，再轉入保鮮袋中密封后放入冰箱，這樣更爲方便。最好放置1-2個星期就開吃吧，可以用奶豆腐做成各種甜品，或者是做一道甜蜜粘牙的拔絲奶豆腐，味道真是極好的。如果沒胃口吃飯，可以做一道楊梅奶豆腐，清涼冰霜酸甜，刺激到胃部之後可以食慾大增呢。
