影響男性性生活的藥物，也會間接影響優生、優育。下列藥物備孕爸爸不能隨意使用。
降壓藥，治療高血壓的利血平，即使劑量較小，也會影響大多數男性病人的性功能，甚至造成不能射精，有的還會誘發抑鬱症，使原有的性功能障礙及性慾低下更趨嚴重。因此準爸爸不宜選用利血平。胍乙啶也容易導致陰莖不能勃起、射精延遲，甚至不能射精。
心血管藥，常用的甲基多巴、肼苯噠嗪(肼酞嗪)、美加明、哌唑嗪，以及治療青光眼和高血壓的可樂定，治療冠心病的洋地黃、地高辛、強心靈，都會導致男性性功能下降。治療心律失常的心得安(普萘洛爾、萘心安)，劑量稍加大，就很容易出現性慾減弱和陰莖勃起障礙等副作用。
中草藥:大多數中草藥是天然植物，副作用不大。但是，對準爸爸而言，中草藥也非絕對保險。例如，雷公藤對精子有不輕的殺傷力。另外，在產棉地區的準爸爸要特別注意，千萬不要食用棉籽油，否則也會誤了生育大計。
免疫調節劑像環磷酰胺、氮芥、順鉑等藥物，其毒性作用強，可直接擾亂精子DNA的合成，包括使遺傳物質成分改變，染色體異常和精子畸形。像男性不孕症，婦女習慣性流產(早期胚胎丟失)，其中部分原因就是男性精子受損的結果。
這些藥物還可隨睾丸產生的精液通過性生活排入陰道，經陰道黏膜吸收後而進入血液循環，使低體重兒和畸形胎的發生率增高，增加圍產期胎兒的死亡率。
在較常應用的藥物中，麻醉劑嗎啡和免疫調節劑環磷酰胺就能通過上述途徑，使低體重兒和畸形胎的發生率增高，而且會增加圍產期新生兒死亡的機會。此外，還有滅滴靈、紅黴素、氨苄青黴素、戊酰氧基甲酯、甲碸黴素、苯丙胺和二苯基海因，都能進入精液，影響胎兒發育。
