食用黃花菜是需要注意的，畢竟黃花菜中含有一種叫做秋水仙鹼的毒素，它對身體是有危害的，所以在食用前一定要先高溫焯水，在高溫60度的水中，毒素可以消失，之後還需要浸泡2小時，這樣才能安全食用。
同時還需要注意，每次食用新鮮黃花菜不超過50克爲好，由於每50克鮮黃花菜大約含有0.1毫克的秋水仙鹼，這個分量是不會引起中毒的。一旦中毒，應該對症治療，特別注意補充水分，不要脫水，不能口服時，要及時靜脈補液。
在食用黃花菜乾品時，食用前需要用清水或溫水進行多次浸泡後再食用，這樣可以去掉殘留的有害物，如二氧化硫等。
