魚肉鬆因爲是直接用魚肉製成的，所以營養也很豐富。魚肉的營養價值更接近人體，魚肉中含有許多人體必需的多不飽和脂肪酸，因此經常吃魚可降低患腦血栓、動脈粥樣硬化、高脂血症等疾病的比率。魚肉中所含蛋白質的氨基酸構成比與人體非常接近，各類營養素的吸收率和生物利用率均比較高。
此外，魚體內還含有豐富的亞油酸、亞麻酸與一定量的二十碳五烯酸(EPR)和二十二碳六烯酸(DHA)，他們是構成人腦極爲重要的營養素，因此纔有吃魚會“變聰明”的說法。魚肉鬆含有人體所需的多種必需氨基酸和維生素B1、維生素B2、尼克酸以及鈣、磷、鐵等無機鹽。魚肉鬆中的可溶性蛋白多，脂肪熔點低，因此吃後較易被人體消化吸收。魚肉鬆通常都是用青魚、草魚以及三文魚等魚類加工製成，每一種魚都有自己的營養特色，可見人們常吃的魚肉鬆都是營養價值非常高的。
