冬季流感不存在最好的藥物，需根據病毒類型和病情嚴重程度用藥效果更好。
冬季流感病毒包括甲型和乙型，用藥時需針對病毒類型。若感染甲型流感病毒，建議服用連花清瘟膠囊，有清瘟解毒和宣肺泄熱的作用，能有效緩解流感症狀。同時也可選擇用鹽酸金剛烷胺片或鹽酸金剛乙胺片，能抑制病毒複製。而乙型病毒感染者可以服用疏風解毒膠囊、金蓮清熱泡騰片等藥物，或應用神經氨酸酶抑制劑類藥物，比如磷酸奧司他韋顆粒。
如冬季流感症狀輕微，患者服用複方金銀花顆粒或太龍雙黃連口服液等，即可獲得較好療效。若症狀嚴重，則需應用抗病毒藥物，臨牀常用帕拉米韋片及金剛乙胺一類藥物。出現咳嗽有痰症狀時，要加服止咳糖漿，必要時還需搭配阿莫西林膠囊等消炎藥。
