冬季寶寶流感咳嗽，根據病情嚴重程度用藥效果好。治療寶寶流行性感冒的藥物主要是抗流感病毒藥物，如神經氨酸酰酶抑制劑、M2離子通道阻滯劑等。通常是選擇神經氨酰酶抑制劑，包括口服磷酸奧司他韋顆粒、海天四季抗病毒合劑、南京同仁堂羚羊感冒口服液等；鹽酸金剛烷胺片是常見的M2離子通道阻滯劑，主要用於預防甲型流感病毒感染。
如果是重型流感，不建議雙倍劑量用藥或連用兩種抗流感病毒藥物，因爲這種情況通常合併細菌或真菌感染，應根據檢查結果合理選用抗生素或抗真菌藥物。如引起急性壞死性腦病，通常無特效治療方法，可應用糖皮質激素以及丙種球蛋白進行治療。用藥期間要進行嚴密監測，防止繼發感染以及病毒複製。
出現咳嗽症狀，主要是應用止咳祛痰的藥物治療，如鹽酸氨溴索分散片、乙酰半胱氨酸泡騰片等。痰液過多、黏稠不易咳出者，可考慮做霧化吸入治療，比如霧化吸入乙酰半胱氨酸溶液等化痰藥。
