1、糞便檢查是最常見的便祕檢查方法，應觀察便祕者排出糞便的形態、是否粘着液體或血液。直腸性便祕是大塊硬糞便，伴有直腸炎症和肛門損傷，糞便常粘液和少量血液粘液。中老年患者經常出現少量血液時，應特別注意腸癌。結腸痙攣性便祕者，糞便硬如羊糞。腸易激綜合徵者經常排出大量粘液，但粘液中紅細胞、白細胞極少。
2、直腸指檢應仔細觀察外痔、肛裂、肛瘻等病變，接觸診察時應注意內痔、肛門括約肌痙攣、直腸壁光滑、潰瘍、新生物等。
3、X線鋇劑灌腸檢查及腹部平片，X線鋇劑灌腸檢查對結腸、直腸腫瘤、結腸狹窄或痙攣、巨結腸等病變的診斷有較大幫助，對結腸的運動功能（蠕動）也可有較全面的瞭解。X線腹部平片如發現多個階梯狀液平，則對腸梗阻的診斷有重要幫助。
4、結腸鏡檢查、結腸鏡檢查對引起便祕的各種結腸病變，如結腸、直腸癌、腸腔內息肉等器質性腸腔狹窄等病變的診斷有很大幫助，結合活組織病理檢查，可獲得確診。
