手足口病皰疹主要通過食物、口鼻飛沫及接觸傳播，因此預防上主要應做到：
（一）加強監測，提高監測敏感性是控制本病流行的關鍵。及時採集合格標本，明確病原學診斷；
（二）做好疫情報告，及時發現病人，積極採取預防措施，防止疾病蔓延擴散；
（三）托幼機構做好晨間體檢，發現疑似病人，及時隔離治療；
（四）被污染的日用品及食具等應消毒，患兒糞便及排泄物用3％漂白粉澄清液浸泡，衣物置陽光下暴曬，室內保持通風換氣
（五）流行時，做好環境、食品衛生和個人衛生；
（六）飯前便後要洗手，預防病從口入；
（七）家長儘量少讓孩子到擁擠公共場所，減少被感染機會；
（八）注意嬰幼兒的營養、休息，避免日光曝曬，防止過度疲勞，降低機體抵抗力
（九）醫院加強預診，設立專門診室，嚴防交叉感染。
