有先天性心臟病的患者到醫院進行檢查時，醫生會根據具體的情況對其進行一系列的治療措施。而這些治療能夠有效地將心臟病進行控制，雖然不能夠很快的非負，但是可以控制病症發展到最嚴重的現象。
1、如果先天性的心臟病不是很嚴重，而是輕微的畸形，例如單純的肺動脈瓣狹窄，房間隔缺損，缺省的直徑小，對於血流沒有很大影響，這時就不需要做任何的治療。她對於身體沒有太大的威脅。
2、嚴重的情況下，例如完全性的大動脈轉都未或者是左心發育不良的綜合徵，這實在出生後就必須進行手術治療，不然患兒將無法生存。對於一些繼發性的病理改變較，要在發生肺血管的組篩改變之前進行手術矯治。在出現梗塞性的心臟病時，要及時的做手術治療。
3、根治的手術能夠使患者心臟的節拍回到正常人的結構。姑息的手術只能改善症狀，不能起到根治效果。這樣的手術方法主要用於複雜的先天性心臟病。對於心臟移植用於中位性的心臟病以及不能夠進行手術方法治療的複雜性的先天性心臟病。
