菠蘿的營養價值之高，更何況是蛋白酶呢？菠蘿蛋白酶是由多種不同分子量和分子結構的酶所組成的酶系，其中至少包含了5種蛋白水解酶。菠蘿蛋白酶用途廣泛，主要運用於食品加工業、醫藥保健品業、以及美容化妝品業。
1、在食品加工業的應用：
1）焙烤食品：將菠蘿蛋白酶加入生麪糰中，可使麪筋降解，生麪糰被軟化後易於加工，並能提高餅乾與麪包的口感與品質；
2）乾酪：用於乾酪素的凝結；
3）肉類的嫩化：菠蘿蛋白酶將肉類蛋白質的大分子蛋白質水解爲易吸收的小分子氨基酸和蛋白質，可廣泛地應用於肉製品的精加工。
2、在醫藥、保健品業的應用：
1）腫瘤細胞的生長：經相關臨牀研究觀察表明，菠蘿蛋白酶能抑制腫瘤細胞的生長；
2）心血管疾病的防治：菠蘿蛋白酶作爲蛋白水解酶對心血管疾病的防治是有益的；它能抑制血小板聚集引起的心臟病發作和中風，緩解心絞痛症狀，緩和動脈收縮，加速纖維蛋白原的分解；
3）於燒傷脫痂：菠蘿蛋白酶能選擇性地除皮，使新皮移植得以儘早進行；動物實驗證明，菠蘿蛋白酶對鄰近的正常皮膚無不良影響；
4）炎作用：菠蘿蛋白酶在各種組織中能有效地治療炎症和水腫(包括血栓靜脈炎、骨骼肌損傷、血腫、口腔炎、糖尿病人潰瘍及運動損傷)，菠蘿蛋白酶具有激活炎症反應的潛力；菠蘿蛋白酶還可治療腹瀉；
5）進藥物吸收：將菠蘿蛋白酶與各種抗生素聯用，能提高其療效；它能促進抗生素在感染部位的傳輸，從而減少抗生素的用藥量。此外，菠蘿蛋白酶能促進營養物質的吸收。
3、在美容化妝品業中的應用：
菠蘿蛋白酶具有嫩膚、美白去斑的優異功效。基本作用原理：菠蘿蛋白酶可作用於人體皮膚上的老化角質層，促使其退化、分解、去除，促進皮膚新陳代謝，減少因日曬引起的皮膚色深現象，使皮膚保養呈現良好白嫩狀態。
