盆腔和泌尿生殖系統手術是除藥物作用外導致醫源性陽痿的又一重要因素。
手術導致陽痿的兩種情況
有些手術後發生陽痿是無法避免的，如對晚期或高齡的前列腺癌患者行雙側睾丸切除術後必然會發生陽痿。對於這種情況的討論並沒有多少實際意義。
手術導致的陽痿更多的情況下是由於副損傷所致，如手術過程中損傷了支配陰莖勃起所需的神經和血管就會導致陽痿的發生，這種情況可以通過提高手術技巧和改進手術方法來儘量避免陽痿的發生。
常見可致陽痿的兩種手術
以往直腸或乙狀結腸根治術後，大部分患者的勃起功能受到影響，甚至發生完全性陽痿，這可能是手術損傷了位於直腸前外側的盆腔神經叢所致。現在通過開展保留自主神經的手術，使術後陽痿的發生率大大降低。
前列腺癌根治術後陽痿的發生曾是一個令泌尿外科界頭疼的問題，術後幾乎不可避免地發生陽痿，但自從開展了保留神經血管束的前列腺癌根治術後，這種尷尬局面得到了改觀。但是術後仍有發生陽痿的危險性，據報道，仍有30﹪~50﹪的患者會發生陽痿，這取決於年齡、腫瘤浸潤的範圍和程度及神經血管束的保留情況。
