寶寶出生後每對父母臉上都洋溢着幸福，但在這充滿幸福的時刻裏家長應密切觀察新生寶寶的健康狀況，比如說寶寶的排便情況，首次排便的時間，大便的性狀等等以便早期發現先天性巨結腸帶孩子進行早期治療。先天性巨結腸需要通過手術治療病情才能緩解，那麼手術治療會不會給患兒帶來後遺症呢？
經過治療一般患兒都可正常進食，腹脹、便祕的情況也基本消失，孩子的體重和正常增長，和健康的寶寶幾乎沒有異樣。
手術治療先天性巨結腸是將病變的腸道組織切除，多數患兒預後良好，但也有不少孩子會留下一些輕微的後遺症，比如說經常會出現胃腸功能紊亂的現象，日後排便問題，雖然不像之前患病時一樣嚴重，但是腹瀉便祕的情況仍然有可能會經常發生。但隨着孩子成長髮育，體質的增強這些症狀多數也可獲得緩解。
另外有少數患兒在手術治療完成後，會出現齒線上吻合口狹窄、反覆腸炎等問題的出現。總體來說，大部分患兒經過手術治療恢復情況都不錯。
