引發錯頜畸形的因素很多，主要是先天遺傳和後天發育影響造成的。下面我們從各方面來了解錯頜畸形的病因。
1、進化因素
人類開始直立行走，頜骨在進化中縮小。隨着火的出現，食物逐漸變得精細，必然也引起咀嚼器官的退化縮小。頜骨縮小遠較牙齒退化明顯，使現代人牙列擁擠，出現錯頜畸形。
2、個體發育
錯頜畸形可以遺傳給下一代，遺傳特徵在雙胞胎中表現尤爲明顯。矯正由遺傳因素造成的錯頜畸形難度較大。由遺傳因素形成的錯頜畸形矯正後仍有可能遺傳，遺傳過程中還會發生變異。
3、先天因素
懷孕期間母體內分泌失調、患病、外傷等可引發兒童先天臉部或牙齒的發育畸形，如脣齶裂、臉部發育不對稱等。
4、後天因素
幼兒時期對乳牙恆牙替換規律疏於管理，乳牙早期脫落出現牙齒重疊或虎牙等。少兒時期習慣性吸吮拇指、咬指甲、異常吞嚥、用口代替鼻子呼吸等不正確習慣未及時發現。
