輸卵管結核的治療過程中，常規的化驗只能作用作參考，可以證明有結核感染，存在活動的病竈，但無法明確病竈的部位。確診還需要做x線，子宮輸卵管碘油造影，腹腔鏡檢查。
輸卵管結核在必要時應該作消化道、泌尿系統的x線檢查，這樣做的目的是爲了找到原發病竈。如果在腹部平片中發現了盆腔中有可疑的孤立鈣化點，這也就是提示了有結核病竈的存在。
進行子宮輸卵管碘油造影，可看到輸卵管當中的狹窄部分，這些狹窄部分形態類似串珠狀，但有時也是細小而僵直的狀態，可以看到輸卵管中的鈣化竈，如果子宮內膜或是盆腔累及，它也會發生改變。子宮輸卵管碘油造影，對於生殖器結核個診斷有重要意義。
輸卵管結核確診通過腹腔鏡檢查可以更加直接的查到盆腔的病變。比如輸卵管有沒有粟粒狀結節附着於漿膜面兒上，輸卵管管是否和周圍的其他組織有黏黏的現象，還可以直接看到輸卵管或是卵巢有沒有增厚的表現。操作時可以直接在病變的部位取出微量組織進行活檢，但應慎重操作，避免使腸管受到損傷，如果仍然無法確診，則應進行剖腹探查。
