一般情況下，結節性甲狀腺腫的原因有接觸致甲狀腺腫物質、缺碘、激素合成障礙。具體分析如下：
1.接觸致甲狀腺腫物質：導致結節性甲狀腺腫大的原因，可能和長期接觸致甲狀腺腫的物質有關，比如一些蘿蔔族的食物中有一種叫硫脲類的物質，該物質會導致甲狀腺腫大。而白菜、黃豆中也有阻止甲狀腺激素合成的物質，從而誘發甲狀腺腫大的情況發生。服用了一些阻礙甲狀腺素合成的藥物和釋放的藥物，比如硫氰化鉀、磺胺類、秋水仙素等，也會導致甲狀腺腫。
2.缺碘：缺碘也會導致甲狀腺腫，在甲狀腺疾病的高發區，當地的食物、土壤、水當中的碘含量都較低。而對於碘化食鹽的攝入可以預防甲狀腺腫大的事實，也能證明缺碘的確可能誘發甲狀腺腫大。另外，機體對甲狀腺激素需求量增多的時候，如果患者體內相對碘不足，也是會加重或者是誘發甲狀腺腫大。
3.激素合成障礙：甲狀腺腫也呈家族聚集性，這是由於遺傳酶的缺陷導致的。如果缺乏過多的脫碘酶和過氧化酶，就會造成加速合成障礙，進而影響到甲狀腺素的合成。或者缺乏水解酶，也會導致甲狀腺激素釋放入血發生困難，進而互相甲狀腺腫的情況。而對於這類先天性缺陷，都屬於隱性遺傳的一種。
除了以上原因，基因突變同樣會導致甲狀腺腫，主要是包括甲狀腺球蛋白基因突變。
