核酸檢測可選擇自己想要的方式進行檢測，其包括咽部、鼻腔及肛門分泌物檢測，但主要以咽拭子檢測爲主。
核酸檢測可以通過檢測呼吸道分泌物，也可以通過糞便檢測，重症患者可以用支氣管肺泡灌洗液進行檢測，患者可根據自身情況選擇不同的檢測方式。新型冠狀病毒以呼吸道繁殖最爲常見，所以通過口、鼻腔採集咽喉部位的上皮細胞進行檢測，其準確率較高。如出現鼻黏膜出血等突發情況，可進行咽拭子、肛拭子檢測，其檢測結果可分爲陰性和陽性。
其次，也可根據自身出現的症狀選擇檢測方法，部分新型冠狀病毒患者出現嘔吐、腹瀉等消化道症狀，此時也可通過肛門分泌物進行肛拭子核酸檢測，是否感染新型冠狀肺炎病毒的唯一判斷標準即爲核酸檢測，但其也可能存在一定程度的假陽性和假陰性，如爲具有流行病學史者，通常在第一次檢測結果陰性後，間隔24小時以上還需進行二次檢測，兩次結果均爲陰性時，方可解除隔離。
