特異性血清病原學檢查是診斷的基礎。
1.酶聯免疫試驗(ELISA)檢測血清中抗-HEVIgM，急性戊型肝炎的診斷指標。抗原採用重組或合成多肽。我國應用本法檢測111例急性戊型肝炎，抗性HEV陽性率爲86.5%的恢復期患者檢測32例，抗性-HEV陽性率6.3%，提示抗-HEV持續時間短，病後5~6月63%轉陰。
2.蛋白質吸印試驗(WesternBlot，WB)此法較ELISA該方法敏感而特殊，但操作方法複雜，檢測時間長。
3.聚合酶鏈反應(polymerassChainReaction,pCR)用於檢測戊型肝炎患者的血清和糞便HEV-RNA，本法靈敏度高，特異性強，但在操作過程中容易造成實驗室污染和假陽性。
4.免疫電鏡技術(IEM)免疫熒光法(IF)用於檢測戊型肝炎患者的糞便、膽汁和肝組織HEV顆粒和HEV抗原(HEAg)。但這兩種方法都需要特殊的設備和技術HEV肝組織、膽汁、糞便存在時間短，陽性率低，不宜作爲常規檢查。
