兒童選外用抗生素時，要有所選擇，以免產生耐藥性。"目前，市場上常用的外用抗生素有複方新黴素軟膏、氯黴素軟膏、紅黴素軟膏、百多邦軟膏等。一般來說，如果使用外用抗生素能控制感染，應該儘量選擇外用藥，而不選擇口服藥和注射劑，這樣無論是在副作用、藥價和耐藥性方面，都有好處。
外用抗生素不僅能治療皮膚感染，還可預防感染。外用抗生素在局部的濃度最高，所以治療和預防表皮或真皮淺層感染的效果最佳。由於全身吸收少，因此副作用小。
但是，由於兒童皮膚薄，血液循環豐富，對外用藥的吸收性強，因此，選用外用抗生素時，應儘量避免長期使用紅黴素軟膏、氯黴素軟膏等，以免產生耐藥性，一旦需要全身用藥時，則會失去效果。
專家建議，兒童外用抗生素最好選用百多邦。百多邦的主要成份是莫匹羅星，與其他抗菌藥沒有交叉耐藥性。這種藥雖然能透入皮膚，但吸收量少。它能治療革蘭氏陽性細菌引起的多種皮膚感染，如膿皰病、癤腫、毛囊炎，以及溼疹、潰瘍、創傷的繼發感染。臨牀觀察表明，百多邦對金葡菌、鏈球菌引起的皮膚感染，療效並不遜色於口服抗生素。
