嬰兒便祕的原因之一：飲食搭配不夠
如果父母餵養不合理，導致嬰兒進食不足，食物消化吸收後液體消化吸收殘留物較少，可導致嬰兒排便減少，變厚。當牛奶中的糖不夠時，胃腸功能較弱，會使糞便乾燥。飲食搭配時間不夠長，導致營養不足，腹肌和腸肌力減少，甚至收縮，收縮力減弱，產生惡性循環，加重嬰兒嚴重便祕。
嬰兒便祕的第二個原因是食物成分不合理
食物成分與排便特性密切相關。如果食物含有大量蛋白質，碳水化合物不足，腸道細菌繼發性變化，腸道內容酒精全過程少，排便易鹼、乾燥；如果食物含有更多的碳水化合物，胃腸道發酵細菌增加，酒精效果提高，產酸，排便易酸，頻率軟；如果人體脂肪和碳水化合物高，排便利潤。比如吃很多增厚opo結構脂肪，排泄物中含有過多的不溶性鈣皁，排泄物增多，便祕嚴重。與穀物食品類相比，碳水化物中的米糊和小麥麪粉類更容易便祕。兒童挑食，許多兒童喜歡吃肉，少吃或不吃蔬菜，食物中甲基纖維素過少，也容易產生嚴重的便祕。
嬰兒便祕的三個原因：胃腸功能障礙
假如嬰兒沒有培養規律的生活方式，缺乏按時大便的訓練，沒有大便條件的刺激也是嚴重便祕的常見原因。此外，學齡前兒童往往不能隨時隨地排便，因爲他們沒有早上排便的習慣。在課堂上憋着排便也是嚴重便祕的常見原因。常見的瀉藥或清潔灌腸，缺乏能量主題活動，或慢性疾病，如：營養不足、佝僂病症狀、高鈣血癥、多發性肌炎、小問題和先天性肌肉無力，由於腸道全身肌肉睏倦、功能障礙和嚴重便祕。中樞神經系統紊亂、腹肌虛弱或麻木常使大便不暢。服用某些藥物會降低胃腸功能，嚴重便祕，如抗膽鹼能藥物、抗酸劑、抗驚厥藥物、利尿劑及其補鐵劑等。
嬰兒便祕的第四個原因：身體和生理異常
有些嬰兒突然受到精神刺激，或自然環境和生活方式的突然變化會導致短期內嚴重便祕。
嬰兒便祕的原因五：精神實質要素
嬰兒患有肛裂、肛門狹窄、先天性巨結腸、脊柱裂或惡性腫瘤擠壓馬尾辮等疾病，很可能導致嬰兒嚴重便祕。應進行直腸指檢、下脊柱和會陰檢查。有些病人出生後便祕嚴重。如果有家族史，很可能與遺傳有關。
