1.生殖器皰疹危害極大，根據國外科研機構的報告，生殖器皰疹可能是導致流產後不孕和男性不育的重要因素。約80%的女性與陰莖皰疹男性有一次性接觸，孕婦生殖器皰疹也可引起子宮hsv新生兒感染和感染對胎兒有嚴重影響。
2.生殖器皰疹傳染性強，危害嚴重，複發率高。近年來，生殖器皰疹患者數量不斷增加，尤其是性活躍者中，約30%患有生殖器皰疹。最新統計顯示，該病的發病率僅次於淋病和梅毒。
3.生殖器皰疹還可引起一系列併發症，如傳播性皰疹、皰疹性腦膜炎、前列腺炎、直腸炎、盆腔炎和脊髓神經根疾病。一些生殖器皰疹病毒hsv-沿神經軸通過周圍神經轉向三叉神經節，hsv-2.骶神經節長期潛伏在神經細胞中。如果身體因創傷、高燒、過敏、月經等原因感染復發，會出現腰髓神經炎、脊髓炎、臀部和下肢放射性疼痛、膀胱麻痹等症狀。
4.易與其他疾病混合感染。在臨牀治療中，發現生殖器皰疹常與淋病、非淋菌性尿道炎、梅毒、尖銳溼疣、陰道念珠菌病、滴蟲等其他性傳播疾病混合。
5、進食困難、窒息：如發生在口腔或喉嚨損傷，患者可出現進食困難、吞嚥困難、聲音嘶啞，嚴重甚至因生殖器皰疹損傷堵塞氣管，導致窒息死亡，特別是嬰兒生殖器皰疹患者易發生。
6、排尿不良：如果生殖器皰疹患者發生在尿道內，患者可出現尿道不適、溢尿、肉眼血尿、尿道口分泌物，會感到尿道堵塞、排尿不良或排尿困難。如果尿道病變嚴重累及膀胱，可發生雙側輸尿管阻塞，導致腎積水、腎感染、腎功能不全。這些也是生殖器皰疹的早期症狀。
