藥物流產有不少優點，也有它的侷限性及副作用，因此不能像感冒發熱到藥房買幾片APC吃那樣簡單，爲了保證婦女健康，藥物流產者必須在有條件的醫療機構中進行。其程序：
（1）用藥前嚴格篩選，包括詢問病史，進行全身體檢和婦科檢查，作實驗室檢查，如尿妊娠試驗、陰道清潔度、滴蟲和黴菌、血常規和血型化驗，必要時做B超檢查。
(2)醫生詳細說明服藥方法、藥物療效和可能發生的副作用，經同意後可用藥物。
（3）目前常用劑量：米非司酮用量爲150～200毫克，可以頓服或分次於3天內服完。第三天在醫院加入前列腺素製劑:懷孕1毫克放在陰道內或米索前列醇600微克口服。在醫院中觀察6小時。
(4)流產過程中的監護人:住院觀察期間，除注意血壓、脈搏、藥物副作用外，排出的大小應保留在清潔的便盆中，負責人檢查胎囊及其排出時間，記錄胎囊的大小和出血量。如果排出胎囊前後有活動性出血，可以給子宮收縮劑或立即止血。
(5)觀察6小時後，如果胎囊沒有排出，出血少，可以回家，根據醫生的規定日期隨訪。在家排出組織的話，必須給醫生看。
