丙型肝炎的預防重點是防止其經血傳播。我國政府從1993年開始對獻血員進行丙型肝炎抗體篩查，1995年開始對輸血工作的管理加大力度;1998年頒佈了《中華人民共和國獻血法》，推行無償獻血。
通過檢測血清丙型肝炎抗體、丙氨酸氨基轉移酶(ALT)，嚴格篩選獻血員，保證病人用血安全，從根本上、源頭大大降低了丙型肝炎輸血傳播的風險。1993年4月-1994年11月，上海市輸血後丙型肝炎的發病率大約在10%左右;1995年以後，上海對獻血者全面實行丙型肝炎抗體的檢測，3年以後，輸血後丙型肝炎的發生率降低到0.6%。
但近年來，其他經血傳播的途徑，包括不安全注射、器官移植、介入性檢查及口腔疾病的治療等，已上升爲丙型肝炎病毒感染的重要途徑。在我國的一些地區，因靜脈注射毒品導致丙型肝炎傳播佔60%～90%;在一些基層醫院裏，透析造成的丙型肝炎流行時有發生，醫源性丙型肝炎感染仍是一個嚴重問題。
因此，醫院應嚴格執行消毒隔離制度，所有需要進行創傷性和介入性醫療操作的患者均應進行丙型肝炎的篩查，靜脈穿刺和注射均應一人一針一管，介入導管不能反覆使用，手術器械應嚴格消毒，嚴防醫源性丙型肝炎感染。
對吸毒人羣要進行教育，用美沙酮替代靜脈注射毒品，引導他們到指定的地點領取一次性注射器，不要共用或反覆使用注射器。另外，應提倡不共用剃鬚刀及牙具等，理髮用具、穿刺和紋身等用具應嚴格消毒。對有性亂史者應定期檢查，加強管理。
對HCV RNA陽性的孕婦，應避免羊膜腔穿刺，儘量縮短分娩時間，保證胎盤的完整性，減少新生兒暴露於母血的機會。對於不明原因的肝功能異常者以及有頻繁輸血和使用血製品史、使用不潔注射器史或使用不潔器械紋身者，都應當重視丙型肝炎病毒感染的風險，到醫院檢查丙型肝炎的檢查。
