潰瘍性結腸炎不會發生癌變，但是病情較爲嚴重，未及時治療危害性較大，會誘發腸狹窄、結腸惡變、內瘻等病發症。
1、腸狹窄
腸道狹窄，有一定特定部位多發於左半結腸、乙狀結腸以及結直腸等部位，其主要誘因是由於腸道黏膜肌層異常增厚或者是假息肉數量過多，堵塞腸腔所致。
2、結腸惡變
結腸惡變與潰瘍性結腸炎密切相關。而惡變趨勢與患者病程長短有關。並且持續時間在15~20年左右，惡變的機率每年會增加1%。因此對於變成在10年以上潰瘍性結腸炎患者要注意避免結腸惡化。
3、內瘻
腸腔之間相互粘連，或者是腸腔與膀胱、陰道等空腔臟器相互粘連會形成內瘻；腸腔與皮膚相連，則易形成外瘻，雖然較爲少見，但是不可忽略。
