男性不育患者就診時，要做全身和局部檢查，目的是找出引起不育的病因，及時治療。
全身檢查包括身高、體重、血壓的測定，以及對男性第二性徵的觀察，如體型、毛髮分佈(重點爲鬍鬚、腋毛、陰毛)、有無乳房女性化、有無嗅覺異常。還要進行各系統的檢查，注意發現有無內分泌、循環系統、呼吸系統、消化系統、神經系統的異常。凡對生育有可能產生影響的病症均應予以重視。
局部檢查主要是對生殖器官的檢查。一般患者直立或平臥，醫生檢查有無生殖器官的異常，包括陰囊是否正常，睾丸的大小、位置和形態，附睾及輸精管有無結節或缺如，有無 精索靜脈曲張，有無鞘膜積液等。
必要時應做肛門指診檢查前列腺、精囊。還應檢查陰莖有無畸形、包莖、硬結，尿道外口有無異常等等。通過以上檢查，可以發現一些疾病的線索，以便進一步做實驗室檢查。
