女兒三歲每天晚上哭鬧可能是因爲生理原因，也可能是因爲腸絞痛、腸套疊等疾病導致的，患者可通過安撫、藥物或手術治療進行改善，具體分析如下：
三歲孩子哭鬧不止可能是衣物穿戴不適或者飢餓等生理因素導致，通過調整衣物、餵奶、創造一個舒適的休息環境等可安撫孩子的情緒。
三歲孩子發生腸絞痛的原因大多是功能性的，腸絞痛的嬰兒通常伴有腸脹氣和便祕，患者可遵醫囑使用二甲基硅油促進腸道氣體排出，使用開塞露改善便祕症狀。
如果孩子發生腸套疊，導致腹痛也會引起每晚哭鬧等症狀，腸套疊的治療分爲非手術療法和手術療法，非手術療法是灌腸療法，灌腸療法只適應於腸套疊在48小時內，全身情況良好的患者。若腸套疊超過48～72小時，或病情嚴重以及小腸型腸套疊均需手術治療，手術治療方式有腸套疊復位、腸切除吻合術和腸造瘻術等。
