有兩種主要的治療方法：藥物治療和手術。然而，由於病因不明，目前尚無治療該病的藥物。藥物治療的目的主要是抑制卵巢功能，導致假妊娠或假絕經狀態。減少異位病竈的活動性和粘連的形成，減輕疼痛，抑制術後殘留病竈，防止復發，縮短復發間隔。
子宮內膜異位症常發生在盆腔腹膜等部位。當然，罕見的子宮內膜異位症也可能發生在膀胱等部位。雖然有的部分子宮內膜異位症屬於良性的，但是其特點是具有與惡性的腫瘤一樣的轉移能力，因此就要及時治療，那麼子宮內膜異位如何治療？
對於子宮內膜異位症的治療可以採用wolf腹腔鏡來進行。這種方法治療子宮內膜異位症是不需要手術的。值得一提的是通過手術治療子宮內膜異位症往往會給人恐懼的感覺，這是手術的性質決定的。但是採用腹腔鏡來治療不手術，對患者也不會造成心理壓力。
腹腔鏡手術治療子宮內膜異位症經常被患者和醫生形象的稱爲鑰匙孔手術，這是因爲通過腹腔鏡治療的時候，不開刀，創傷非常小，幾乎比鑰匙孔都要小很多。治療的時候只需要一個兩釐米左右的小孔就可以了，更值得一提的是，治療完畢之後幾乎是一張創可貼貼在手術部位就可以自己康復了。
腹腔鏡手術治療子宮內膜異位症具有其他任何辦法都不發比擬的優勢。腹腔鏡治療子宮內膜異位症的時候幾乎對人體的任何內臟器官造成牽拉後者移動，而且治療之後的效果非常直觀，不會有漏診或者誤診的現象發生。
在通過治療之後患者最好不要吃過於寒涼的飲食，多吃一些新鮮的水果和蔬菜，適當的進行一些戶外活動，改善自己的機體免疫能力。手術後的一個月內不要過夫妻生活。
子宮內膜異位症的辨證論治必須着眼於血瘀及其複雜之病理變化。可以利用中西醫結合方法，通過口服中藥、中藥保留灌腸、中藥離子導入等方法治療，必要時需要手術治療。
