麻疹不會遺留後遺症，但是合併腦炎，則會對神經系統產生影響，影響智力、誘發癲癇、癱瘓等後遺症。
1、影響智力
麻疹合併有腦炎被稱爲麻疹性腦炎發病率較低，僅爲0.01%~0.5%左右。通過腦電圖檢查發現麻疹性腦炎患者腦電圖顯示異常，病毒侵犯的腦組織，誘發腦組織產生病變，影響患者治理，導致智力下降。
2、癲癇
麻疹侵犯到腦組織會對腦神經產生影響，造成腦神經異常。而癲癇發作是由於腦神經異常放電所致。因此，麻疹性腦炎未及時治療可誘發癲癇等神經系統性疾病。
3、癱瘓
麻疹病毒直接侵犯到腦部神經中樞系統，會影響腦部神經中樞系統功能，導致患者出現運動障礙、肢體不協調，嚴重時肢體症狀活動受限，引起癱瘓。
