服用緊急避孕藥一般不會影響月經週期，但如果靠近月經週期服用或一個月經週期服用過多，可能會使月經週期推遲或者提前，一般推遲或提前一週左右屬於正常情況。
嚴格按照說明書使用緊急避孕藥，一般對人體沒有影響，但如果長期或大量服用，可能會導致月經週期不規律，建議不要長期或大量服用緊急避孕藥。
此外，少數人對藥物敏感，服用緊急避孕藥後可能有陰道出血，但不必每次都擔心。這是經期出血，是藥物發揮作用的表現，是正常情況。
月經不調的女性應儘量少服用緊急避孕藥，如需服用，建議服用碧韻、華典等米非司酮類緊急避孕藥。
服用緊急避孕藥的危害
關於緊急避孕藥，其副作用主要包括噁心、嘔吐、月經紊亂，但長期盲目、大量服用，結果極其嚴重。緊急避孕藥含有大量的妊娠激素，長期服用副作用會抑制排卵，使女性發胖，增加血栓和偏頭痛的風險。特別是青少年，大量服用緊急避孕藥的副作用包括閉經的可能性和卵巢早衰的可能性。反覆長期服用緊急避孕藥，容易發生意外懷孕。人流次數越多，危害越大，輕度損傷子宮頸重度失去生育能力不育。
而且，緊急避孕藥中含有的大量激素會改變女性體內的正常激素水平，反覆服用會導致月經紊亂，長期大量服用會導致不育等危害。
很多人爲了方便省事，不想採取可靠的避孕措施，經常服用左炔諾孕酮片進行緊急避孕，但緊急避孕只是臨時的補救措施，不能用於普通的避孕，左炔諾孕酮片是高效的妊娠激素，過量服用必然會危害健康，引起女性內分泌紊亂，月經不調，嚴重時甚至會引起子宮大出血等後患。
特別要注意的是，一個月內服用緊急避孕藥不得超過一次。過量服用緊急避孕藥會帶來明顯的副作用和危害。因此，緊急避孕藥一年只能服用三次的說法有科學依據。專家注意到，緊急避孕藥含有大量妊娠激素，對女性的危害非常大，不能作爲日常避孕的選擇。
服用緊急避孕藥的注意事項
如果必須服用緊急避孕藥，請看以下服用緊急避孕藥的注意事項。
緊急避孕藥只能在上次性生活中發揮事後避孕作用，服用藥物後不能發生防護措施的性交。
服藥後有少量陰道出血不是避孕成功的標誌，如果沒有月經量樣出血，應及早到醫院檢查。
服藥後1小時內嘔吐，應儘快補充。
緊急避孕藥只能偶爾使用，不能代替通常的避孕方法。
懷孕的婦女禁用緊急避孕藥。因爲緊急避孕藥對確立的懷孕沒有流產作用。
無保護措施性生活後服藥越早，防止意外懷孕效果越好。
