服用緊急避孕藥一般不會影響月經週期，但如果靠近月經週期服用或一個月經週期服用過多，可能會使月經週期推遲或者提前，還會引起月經不調或內分泌紊混亂等問題。
嚴格按照說明書使用緊急避孕藥，一般對人體沒有影響，但如果長期或大量服用，可能使月經週期以及分泌混亂變得不規則，建議不要長期或大量服用緊急避孕藥。
另外，少部分人對藥物較敏感，服用緊急避孕藥後可能有陰道出血的現象，但不會每次都出現這種現象，其實不必擔心，這屬於經間期出血，是藥物起到作用的表現，是正常情況。
月經不調的女性應該儘量少的服用緊急避孕藥，如果需要服用，建議服用碧韻、華典等米非司酮類的緊急避孕藥。
