乳糖不耐受主要因乳糖酶缺乏引起，其中先天性乳糖酶缺乏與遺傳、種族等因素有關，繼發性乳糖酶缺乏由腸炎引起，年齡增長可導致乳糖酶活性下降，導致乳糖不耐受。
一、先天性乳糖酶缺乏、活性不足
先天性乳糖酶缺乏、活性不足多發生於新生兒中，其發生與遺傳、種族有關。由於乳糖酶缺乏及活性不足程度各不相同，其症狀也不同。
二、繼發性乳糖酶缺乏
腸炎可導致腸絨毛頂端受損，導致乳糖酶缺乏。許多早產兒、新生兒由於腸黏膜發育不成熟，出現暫時性乳糖不耐受。
三、成人型乳糖酶缺乏
隨年齡增長，人體內乳糖酶活性逐漸下降，可引起乳糖不耐受。其發生率與種族有關，黃種人與黑人比白人發生率高。
