不孕不育的常規檢查如卵巢功能評估，男方精液分析均正常，並經腹腔鏡檢查亦未發現異常的夫婦即可診斷爲原因不明性不孕症。因患者年齡越大懷孕機會越少，高於35歲者機會更少，且不孕時間愈久懷孕機會愈少。因此，對原因不明性不孕患者，不孕時間較長或妻子年齡較大的夫婦應採取積極治療措施。
(1)氯米芬的應用：應用此法治療有效，簡單，價廉，副作用小。常規用量：氯米芬50mg，1次/日，5天，月經第3 - 5天始服，可通過測量基礎體溫、B超監測卵泡等方法，在醫師指導下調整藥量。
(2)宮腔內人工授精(IUI)：可在自然週期或促排卵週期，於女方卵泡成熟時將男方精液洗滌優化後送入女方子宮內，前提條件爲：女方輸卵管;必須通暢。這樣可使受精時間準確，也可通過促排卵方法將不明顯的排卵問題解決。同時也是對輕度少弱精男性患者的合適治療。
(3)體外受精一胚胎移植(IVF-ET)：國外曾有人報道，不明原因不孕症存在受精缺陷，約佔5.2%，所以體外受精可能失敗機會多。如果受精失敗，可行卵母細胞單精子注射技術(ICSI)。
