生殖器皰疹出現低燒、頭痛、肛門直腸疼痛等症狀，嚴重者皰疹可轉變爲水泡，伴糜爛症狀，康復後有瘙癢症狀。
一、低燒頭痛
有些男性患生殖器皰疹後，有全身性不適症狀，如出現局部淋巴結腫大、低燒或頭痛。
二、肛門直腸疼痛
若是男同性戀者，可出現肛門直腸疼痛，分泌物逐漸增加，嚴重便祕，肛周部位出現明顯皰疹性潰瘍。
三、形成水泡
原發性生殖器皰疹經潛伏期後，患病部位有灼熱感，後期出現一大片丘疹，逐漸形成水泡，若沒有及時治療，出現糜爛樣，大概維持2~3個星期。
四、局部瘙癢
生殖器皰疹出現瘙癢感，甚至感染部位有麻木感，像被灼燒一樣。
