通常情況下，生理性黃疸和病理性黃疸的區別有發病原因不同、發病時間不同、症狀嚴重程度不同、治療方法不同、預後不同等。具體分析如下：
1.發病原因不同：生理性黃疸和病理性黃疸的發病原因具有本質上的不同之處。其中生理性主要由於膽紅素代謝功能發育不完善所致，與肝臟功能生長髮育不到位有關。而病理性黃疸可能是膽紅素生成過多或代謝障礙誘發，不少患者存在有先天性代謝缺陷疾病或者肝炎等肝臟疾病。
2.發病時間不同：生理性黃疸會在新生兒出生3-4天之後發病，起病相對比較緩慢，在經過7-8天左右之後會讓膽紅素含量達到高峯狀態，持續兩週即可逐漸下降，並恢復到正常狀態。若是病理性因素所致的黃疸，可在48小時之內迅速發病，黃疸值也會達到最高水平，病情持續時間可能會超過一個月。
3.症狀嚴重程度不同：儘管兩種黃疸都會引起皮膚黃染，但嚴重程度有很大區別。生理性黃疸一般只會讓面頸部皮膚出現淺黃色或者檸檬色，鞏膜和尿液顏色微黃。但病理性比較嚴重，可導致四肢、手腳心等身體多部位皮膚都變成金黃色，甚至尿布也會出現明顯黃染現象。另外，病理性黃疸還可引起精神異常，出現餵養困難和四肢抽風的反應。
4.治療方法不同：生理性黃疸可不必接受特殊性治療，具有自行消退的特點，只要平時多曬太陽，可以促進症狀緩解。而病理性往往需要使用藍光照射和藥物療法治療，可以服用茵陳丹蔘湯等中藥方劑，必要時還要進行換血治療。
5.預後不同：生理性黃疸的預後通常良好，隨着膽紅素排泄機能的成熟，黃疸會自行消退。病理性黃疸的預後取決於引起疾病的嚴重程度和治療的有效性。
如有不適，建議及時就醫。
