同所有的臨牀檢查一樣，無痛內鏡檢查並不是適合所有的人。那麼，什麼情況下該做無痛內鏡，什麼情況又是絕對的禁忌呢? 首先，具有下列情況者要選擇無痛內鏡：
①有內鏡檢查適應症，但恐懼心理嚴重，以至於影響檢查效果者；
②劇烈乾嘔或其他原因難以完成常規胃鏡檢查者；
③伴有其他疾病而病情又非常必要做胃鏡檢查者，如伴有可控制的高血壓、輕度冠心病、陳舊性心肌梗死心功能較好、有癲癇病史的病人；
④小兒患者或精神病患者等不能合作者。
由於無痛內鏡要靜脈使用會對人體產生不良影響的麻醉劑、鎮靜劑和止痛劑等藥物，所以，無痛內鏡並不是適合所有人的，有下列情況的就不能選擇無痛內鏡來進行檢查和治療。
①一般不能選擇常規內鏡者都不能選擇無痛內鏡，但小兒和精神疾病患者除外，因爲他們正是無痛內鏡的最適合人羣；
②有藥物過敏史，特別是有麻醉、鎮靜藥物過敏史者是絕對不能選擇無痛內鏡的；
③孕婦及哺乳期婦女，因爲藥物會影響到胎兒或小孩；
④患有容易引起窒息的疾病，如支氣管炎多痰者、胃內殘留物較多者、嚴重鼾症和睡眠呼吸暫停以及過度肥胖者宜慎重；
⑤心、肺疾病不能耐受麻醉者，青光眼、前列腺增生症有尿瀦留史患者。
