許多患者對前列腺炎認識不足，經常混淆前列腺炎和泌尿系統的其他疾病，延誤治療。
慢性前列腺炎根據病史、症狀、直腸診斷、前列腺液檢查等一般診斷不難，但對症狀複雜、體徵不典型的人應與以下疾病進行鑑別。
1、前列腺膿腫:急性細菌性前列腺炎併發症多發生在50~60歲，半數患者急性尿滯、尿頻、排尿困難、直腸不適、尿道流膿、附睾炎。直腸診斷前列腺疾病側增大，觸摸柔軟，有波動感。偶爾前列腺膿腫可以自然向尿道破裂，也可以向直腸破裂，被誤認爲是直腸周圍的膿腫。
2、前列腺疼痛:這些患者持續尿頻、尿痛、排尿困難，會陰、下腹、腰骶等部位疼痛不適，久坐、騎自行車後惡化。直腸診斷兩側肛提肌壓痛明顯，前列腺接觸正常，無壓痛。過去，這種疾病被稱爲梨狀肌肛提肌症候羣，前列腺液鏡檢查正常，無細菌培養生長。
3、前列腺結核:症狀與慢性前列腺炎相似，但常有泌尿繫結核或其他部位結核病竈的病史，直腸診斷前列腺呈不規則結節狀，睾丸腫大硬化，輸精管呈串珠狀硬結，前列腺結核桿菌直接塗層或PCR檢測結核菌。
4、前列腺結石:指前列腺泡內和腺管內發生的結石。前列腺位置置炎症、前列腺積液、腺管狹窄、代謝紊亂等因素有關。無機鹽如草酸鈣、磷酸鈣、磷酸鎂等沉積在前列腺泡沫內的澱粉樣本體，上皮細胞和炎性滲出物形成結石，患者可以表現出慢性前列腺炎的各種症狀，但直腸診斷表明前列腺有結石摩擦感，骨盆x線在恥骨聯合區側有陽性結石影，超聲波檢查表明前列腺結石部有強光帶，有聲影。
5、恥骨骨炎:臨牀上常出現慢性前列腺炎症狀，但肛門診斷和前列腺液檢查正常。主要特徵是恥骨聯合處有明顯的壓痛，骨盆x線片顯示恥骨聯合間隙擴大>10毫米，雙側恥骨上支水平差>2毫米，恥骨聯合邊緣不規則，出現侵蝕和反應性骨硬化。
6、前列腺癌:末期可出現尿頻、尿痛、排尿困難等症狀，但患者經常出現消瘦、疲勞、貧血、食慾不振等明顯全身症狀，直腸診斷前列腺有硬塊，表面高低不平，血清前列腺特異抗原和前列腺酸性磷酸酶增高。前列腺穿刺活檢可發現癌細胞，B超顯示腺體增大，邊界回聲不整齊或有缺陷，內部光點不均勻，癌腫部位有亮點或光團。CT檢查顯示前列腺形態不對稱，腫瘤浸入包膜外，精囊和膀胱後壁的組織間隙消失。CT可以確定前列腺癌的浸潤程度。
7、急性腎盂腎炎:急性腎盂腎炎多見於女性，男性極少見，急性腎盂腎炎引起的腰痛多爲單側腎區，敲擊痛明顯。急性前列腺炎引起的腰痛多爲腰骶部中央，腎區無磕傷。急性前列腺炎前列腺液中可大量膿細胞，急性腎盂腎炎主要是尿性質的變化。
