一、卵巢腫瘤
漿膜下子宮肌瘤和實質性卵巢瘤、囊性變性和囊性卵巢瘤、張力大或卵巢瘤與子宮粘連，鑑別困難。詳細詢問月經史和腹部腫塊生長速度（惡性卵巢瘤較快），並仔細進行婦科檢查。對腹壁緊張的婦科檢查不滿意的，可使用麻醉藥物或止痛劑進行檢查。檢查包括肛門診斷，注意子宮體是否能與腫塊分離，並用子宮探針測量子宮腔的長度和方向。分析綜合病史和檢查。肌肉注射催產素10單位，注射後腫塊收縮爲子宮肌瘤，否則爲卵巢腫瘤。在大多數情況下，B超顯象檢查可以區分。但有些必須在手術中確診。
二、宮內妊娠
懷孕前三個月，個別孕婦仍有少量出血，如誤認爲月經正常，子宮增大，常誤診爲肌瘤。應詳細詢問以往的月經史（包括數量）、是否有生育史、年齡（年輕肌瘤的機會較少）；還應注意是否有妊娠反應。如果是懷孕，子宮增大符合月經減少的月份；肌瘤患者子宮硬。此外，孕婦的外陰和陰道呈紫藍色，宮頸柔軟，乳房腫脹，乳暈外有次暈。妊娠4個月後，可感覺胎動或聽到胎心音，用手觸摸子宮收縮。除病史、體徵外，還可進行妊娠試驗或B超檢查。
過期流產伴有不規則陰道出血，尿妊娠試驗呈陰性反應，易誤診爲子宮肌瘤。但過期流產者有更年期史，有妊娠反應，子宮形態正常。B超檢查，一般可以診斷。必要時，可以進行刮痕識別。
子宮肌瘤可合併妊娠，也必須認爲，否則或漏診妊娠或誤診爲葡萄胎。過去，如果發現肌瘤，目前有早孕史和體徵，而子宮大於更年期，無陰道出血，妊娠試驗呈陽性，則診斷無困難。但過去未確診的人應詳細詢問月經是否過多，是否有不孕史。檢查時注意子宮是否有肌瘤突出，必要時密切觀察。如果是葡萄胎，更年期後經常會有少量陰道出血，而腹部腫塊在短時間內生長，妊娠試驗呈陽性，滴定度高；B超聲檢查葡萄胎呈雪片狀獨特波形。
三、子宮腺肌病
半數以上的子宮腺肌病婦女伴有嚴重的繼發性漸進性痛經，常有原發性或繼發性不孕。但妊娠子宮很少超過2~3個月。在子宮外伴有子宮內膜異位症的情況下，有時會在後穹頂接觸到疼痛小結節。此外，還可以嘗試用黃體酮治療，觀察其效果，以識別。但子宮肌瘤合併子宮腺肌病者也不少見，約佔肌瘤的10%左右。C超檢更有利於鑑別。在手術切除標本的病理學檢查中，其他無症狀或B超未發現的患者往往可以明確。
四、子宮肥大
這種疾病也導致月經過多，子宮增大，容易與小壁間肌瘤或宮內粘膜下肌瘤混淆。然而，子宮肥大通常有多產史，子宮增大均勻，無不均勻結節，子宮增大通常懷孕約2個月，檢測子宮腔無變形，無腫塊。B肌瘤結節在超檢。
