1、妊娠子宮：當子宮肌瘤併發囊性變化時，容易誤診爲妊娠子宮；妊娠子宮，特別是40歲以上的孕婦，或過期流產和出血，也可誤診爲子宮肌瘤。在臨牀上遇到育齡婦女和有更年期史的人，應首先考慮懷孕的可能性，經過B型超聲檢查或hCG確診不難，必要時刮宮鑑別。應特別注意肌瘤合併妊娠，此時子宮大於絕經月，形狀不規則，質地硬，B超聲檢查有助於診斷。
2、卵巢腫瘤：實性卵巢腫瘤可能誤診爲漿膜下肌瘤；反之，漿膜下肌瘤囊性變也常誤診爲卵巢囊腫，當卵巢腫瘤與子宮有粘連時鑑別更爲困難，可作B型超聲檢查，有時需在剖腹探查時方能最後確診。
3.子宮肌腺瘤:臨牀上也表現爲月經量增加和子宮增加。與子宮肌瘤明顯不同的是，痛經是主要症狀，痛經不明顯的人經常被診斷爲子宮肌瘤。檢查時子宮均勻性增加，經期增加，經後縮小。
4.子宮肥大:這類患者的主要臨牀表現是月經增多和子宮增大，容易與子宮肌瘤混淆。但這種疾病是子宮均勻增大，妊娠子宮很少超過2個月。B超聲可以幫助診斷。
