如果發現化膿性腦膜炎症狀，那麼要如何進行檢查診斷呢？根據急性起病的發熱、頭痛、嘔吐，查體有腦膜刺激徵，腦脊液壓力升高、白細胞明顯升高，即應考慮本病。要確診的話，還需要有病原學證據，包括腦脊液細菌塗片檢出病原菌、血細菌培養陽性等。
1、常規實驗室檢查
血常規：白細胞總數及中性粒細胞明顯增加。貧血常見於流感桿菌腦膜炎。
血培養：早期、未用抗生素治療者可得陽性結果。能幫助確定病原菌。
咽拭子培養：分離出致病菌有參考價值。
瘀點塗片：流腦患兒皮膚瘀點塗片查見細菌陽性率可達50%以上。
2、 腦脊液檢查：
常規：可見典型化膿性改變。腦脊液外觀混濁或稀米湯樣，壓力增高。鏡檢白細胞甚多，可達數億/L。
生化：糖定量不但可協助鑑別細菌或病毒感染，還能反映治療效果。蛋白定性試驗多爲強陽性，定量每在1g/L以上。
細菌學檢查：將腦脊液離心沉澱，作塗片染色，常能查見病原菌，可作爲早期選用抗生素治療的依據。
免疫學檢查：
（1）對流免疫電泳：這是以已知抗體（特定的抗血清）檢測腦脊液中的抗原（如可溶性莢膜多糖），特異性高，常用作流腦快速診斷，也用以檢查流感桿菌、肺炎鏈球菌等，陽性率可達70%～80%。
（2）對腦膜炎雙球菌與流感桿菌檢測結果，與用CIE方法所測結果相似，但對肺炎鏈球菌敏感性較差。這種法子較CIE敏感，但有假陽性可能。
（3）用熒光素標記已知抗體，再加入待檢抗原（如腦脊液、血液標本），然後用熒光顯微鏡觀察抗原抗體反應。此法特異性高、敏感性強，可快速作出診斷，但需一定設備。
（4） 酶聯免疫吸附試驗。
（5） 鱟蛛溶解物試驗 ：（1）正常腦脊液中免疫球蛋白量很低，IgM缺乏。化腦患兒IgM明顯增高，如大於30mg/L，基本可排除病毒感染。（2）正常腦脊液LDH平均值：新生兒53.1IU；乳兒32.6IU；幼兒29.2IU；學齡28.8IU。LDH同功酶正常值；新生兒 LDH127%，LDH235%,LDH334%，LDH243%，LDH51%。出生1個月後，LDH137%，LDH232%，LDH328%，LDH42%，LDH51%。化腦病兒LDH值明顯升高，同功酶中LDH4及LDH5明顯上升。
3、 影像學檢查
最後，檢查化膿性腦膜炎還會用到影像學檢查，但是影像學檢查的診斷和鑑別診斷意義有限。部分患者表現爲增強後腦膜和腦皮層增強信號，但無增強表現亦不能排除診斷。影像學檢查的真正意義在於瞭解腦膜炎的中樞神經系統併發症，如腦膿腫、腦梗死、腦積水、硬膜下積膿和靜脈竇血栓形成等。
有了診斷依據，那麼要如何鑑定呢？
（1）病毒性腦膜炎。如果是病毒性腦膜炎，那麼腦脊液白細胞計數通常低於1000×10∧6/ L，糖及氯化物一般正常或稍低，細菌塗片或細菌培養結果陰性。
（2）結核性腦膜炎。一般來說，結核性腦膜炎都是亞急性起病，腦神經損害常見，腦脊液檢查白細胞計數升高往往不如化膿性腦膜炎明顯，病原學檢查有助於進一步鑑別。
（3） 隱球菌性腦膜炎。這種疾病通常隱匿起病，病程遷延，腦神經尤其是視神經受累常見，腦脊液白細胞通常低於500×10∧6/L，以淋巴細胞爲主，墨汁染色可見新型隱球菌，乳膠凝集試驗可檢測出隱球菌抗原。
