任何治療都需要花費許多的時間和精力，金錢的損失也必不可少。在這種情況下，最好的治療第一步是預防。
首先，女性的適婚適育年齡在三十歲左右，而35歲以上的孕婦發生胎兒基因異常的風險明顯增加，因此最好在35歲以前生育。如果在三十五歲以後生育，那麼最好做好萬全準備，做好預期調理。
其次，生育孩子最好做好心理、生理狀態的調節，加強對孕婦的保健，孕期儘量少接觸射線、電磁輻射等不良環境因素，避免去高海拔地區旅遊。
最後，先心病治療的外科手術方法主要根據心臟畸形的種類和病理生理改變的程度等綜合因素來確定，手術方法可分爲三種。
第一，根治手術可以使患者的心臟解剖回到正常人的結構；
第二，姑息手術僅能起到改善症狀的作用而不能起到根治效果，主要用於目前尚無根治方法的複雜先心病，或者作爲一種預備手術爲根治手術創造條件；
第三，心臟移植主要用於終末性心臟病及無法用目前的手術方法治療的複雜先心病。
