九價和四價的區別在於針對人羣不同、預防的病毒類型不同，價代表疫苗可預防的病毒基因類型，價數越多，預防效果越好。
四價疫苗可以有效預防HPV6、11、16和18型病毒，約70%的宮頸癌、外陰溼疣等疾病，九價疫苗可以預防HPV16、11、18、31、33、45、52和58型HPV病毒，約90%的宮頸癌、肛門癌、溼疣等疾病，其預防病毒的種類有所不同。
四價疫苗適用於20-45歲的女性，九價疫苗適用的範圍是16-26歲的女性，四價疫苗與九價疫苗的預防效果相近，可通過自身年齡選擇疫苗種類。
