骨囊腫會引起病理性骨折，會導致下肢畸形，可能引起截癱和面部畸形。
1、導致病理性骨折
骨囊腫出現在長骨上時，不但會伴隨局部腫脹、疼痛等不適症狀，出現病理性骨的機率會大大增加，有時只是輕微損傷，就會骨折，出現劇烈疼痛感，正常活動會受限等。
2、造成下肢畸形
骨囊腫出現在下肢時，會導致下肢生長緩慢，造成雙下肢不等長，走路跛行。
3、出現截癱
如果骨囊腫出現在脊柱，侵犯到脊髓或壓迫到神經根時，會導致腰疼、下肢萎縮、大小便失禁等，嚴重時會出現截癱，患者只能臥病在牀。
4、誘發面部畸形
如果是牙齒反覆受到炎症刺激或出現損傷，會引起牙源性頜骨囊腫，此時常會出現面部畸形，影響美觀。
