慢性咳嗽用藥主要以吸入性激素爲主；上氣道咳嗽綜合徵常用抗組胺或鼻沖洗，中成藥可以選用三黃片、蘇黃止咳膠囊等等；反流性食道炎要用抑酸性藥物及生活調理爲主。不同的疾病選用不同的方法。最重要的是弄清慢性咳嗽是什麼原因導致的，再談用什麼藥進行治療。
慢性咳嗽，它指的是在以往的過程當中，沒有相應的慢性呼吸系統疾病的病史，胸部體驗和胸片都沒有任何異常的發現，也就是排除了肺癌等器質性疾病。服用常使用的抗感染和鎮咳治療後沒有任何效果。慢性咳嗽這一類的患者很容易被醫生和病人自己疏忽。那麼，慢性咳嗽用什麼藥？
對於慢性肺炎疾病的治療，醫生往往建議患者採取口服藥物的方法進行治療，在這裏提醒患者注意的是，治療慢性肺炎的時間比較長，患者應該有耐心，現在人們常用的治療慢性肺炎的藥物有：肺寧顆粒、羅紅黴素膠囊、複方磺胺甲惡唑片等等。
慢性肺炎患者的主要症狀就是咳嗽，咳痰，以及呼吸困難，有的患者的肺部會出現羅音，在這個時候患者就需要及時進行相關的治療，緩解這種症狀，在必要的時候，患者還可以通過痰液培養進行治療。
超過了三個星期的持續咳嗽，就稱爲慢性咳嗽。當然也有一些學者認爲，超過了八個星期的咳嗽才稱爲慢性咳嗽。咳嗽性哮喘是慢性咳嗽中最常見的。該病的，唯一症狀就是咳嗽。所以，臨牀特點缺乏特異性誤診率也非常高。
和典型哮喘一樣，咳嗽變異性哮喘治療主要是以吸入糖皮質激素進行抗炎治療爲主，通常情況下需要連續吸入一個星期。在氣道炎症控制後，咳嗽症狀有明顯的消失或者減輕後。爲了避免復發，吸入糖皮質激素的時間，最少要持續三個月。
如果咳嗽的情況非常嚴重，可以配合應用支氣管擴張劑和口服茶鹼類的藥物，這樣可以減緩咳嗽症狀。停藥後又反覆發作，對於這樣的患者，應該及時查清過敏原採取有效的防禦手段。
