莖體上長小顆粒可能是珍珠狀陰莖丘疹、過敏反應、尖銳溼疣等疾病引起的，可以根據病因及病情輕重，相應選擇藥物治療、物理治療、手術治療等方法改善。
包皮過長，又不注意個人衛生，使包皮下藏污納垢，反覆刺激陰莖時，可能誘發珍珠狀陰莖丘疹，在陰莖上有許多珍珠狀小顆粒，通常無其他不適感，注意個人衛生就能使小顆粒自行消退。如伴隨包皮過長，珍珠狀陰莖丘疹反覆出現時，可做包皮環切手術。
陰莖接觸過敏源引起過敏反應時，也會在陰莖上出現許多小顆粒，並伴隨劇烈瘙癢感。應用氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片、糠酸莫米鬆乳膏等藥物對抗過敏，緩解不適症狀。
有不潔性生活或高危性行爲，在陰莖上出現淡紅色顆粒，隨着病情發展逐漸增多，呈菜花狀、雞冠狀，可能是感染人乳頭瘤病毒，誘發了尖銳溼疣。可用重組人干擾素α1b注射液、鬼臼毒素溶液、咪喹莫特乳膏等對抗病毒，採取冷凍、激光、電灼等方法促使疣體脫落。注意用藥需遵醫囑，避免盲目用藥。
