避孕藥會有意外懷孕的情況，雖然避孕藥的避孕效果比較高，但並不能達到100%，短效避孕藥漏服，緊急避孕藥超出正常的服藥時間或對藥物成分不敏感，發生意外懷孕的可能性比較大。
大部分的避孕藥都有比較好的避孕效果，但並不能100%避孕，也就是說仍然有意外懷孕的可能性。常見的是短效避孕藥，這種避孕藥一個月內要連續服用20多天，如果沒有漏服，避孕失敗的機率比較小，避孕成功率能達到98%~99%。若是出現漏服現象，沒有及時補服，很可能會導致避孕失敗，出現意外懷孕的現象。
緊急避孕藥屬於事後避孕藥，需要在同房後的72小時內服用，避孕效果比較好，但也有意外懷孕的可能。緊急避孕藥中含有大量的孕激素，服藥時間越早，避孕成功率越高，若是服藥時間超過72小時，效果會大大減弱，從而造成意外懷孕。部分人對於緊急避孕藥中的成分並不敏感，雖然按時服藥，但還是有意外懷孕的可能。
