病毒性肝炎：主要是乙型與丙型肝炎病毒感染，尤其是乙肝與乙肝病毒攜帶者，其原發性肝癌的發生率要比正常人高出12～100倍；約80%的肝癌患者可查到乙型肝炎的e抗原、e抗體與核心抗體三項指標皆爲陽性。
黃麴黴毒素（AFT）：以黃麴黴素民爲最重要的致癌物質。適宜於高溫、高溼的氣候環境中生長繁殖，尤其是夏季的黴變食物及穀物、飼料等，最易被黃麴黴菌污染而產生黃麴黴毒素，長期食用含此毒素的食物可誘發肝癌。
水源污染：飲用水質的嚴重污染，是肝癌發生的重要誘因之一，尤其是污染的溝水，其次爲河水，井水最低。放在沒有自來水設施的鄉村，應提倡飲用井水。
化學致癌物質：能引起肝癌的化學物質以體亞硝基化合物爲主，如亞硝肢和亞硝酸胺等。此外，農藥、酒精、黃樟素等亦均能誘發肝癌。
其他因素：營養過剩（大量營養素）或營養缺乏（如維生素AB2缺乏）、血色病、寄生蟲感染及遺傳等，也是誘發肝癌的危險因素。
免疫狀態：有人認爲肝癌患者血漿中含有一種封閉因子，能抑制細胞免疫並保護肝癌細胞不受免疫細胞殺傷。現已證明，甲胎蛋白（AFp）就能抑制淋巴細胞和巨噬細胞的吞噬作用。
基因突變：近年來，還有人認爲，環境中的突變原和病毒作用激發肝細胞分裂反應途徑的活化，引起細胞的點突變和基因易位，是加速場細胞增殖的可能因素。
