1、慢性尿道炎或膀胱炎:其臨牀表現與慢性前列腺炎相似，但前列腺檢查無異常。
2、前列腺疼痛:無實質性病變，表現爲會陰部和恥骨上區疼痛和壓痛，有排尿障礙等尿路表現。前列腺觸診正常，前列腺液鏡檢正常，前列腺液及尿液培養無細菌。
3、肉芽腫性前列腺炎，儘管症狀、直腸指檢易與慢性前列腺炎混淆，但前者進展快，可迅速發生尿瀦留，短期內硬結生長較快。需要前列腺活體組織檢查鑑別，組織學檢查顯示肉芽腫性反應。
4、卡特性前列腺炎或前列腺病(也稱非細菌性前列腺炎)臨牀症狀與慢性前列腺炎難以區別。會陰部疼痛不適，有排尿和功能障礙等表現。前列腺液檢查卵磷脂小體多，白細胞增多，但塗層和細菌培養無細菌生長。
5、前列腺溢液(也稱無菌前列腺炎、前列腺泄漏或慢性前列腺充血):大、小便結束時乳白色分泌物從尿道流出，經常合併精神症狀。但直腸指檢、前列腺液鏡檢查均正常，細菌學檢查陰性。
6、前列腺癌:晚期可出現尿路症狀。直腸指檢發現前列腺有硬塊，表面高低不平。前列腺液塗層、穿刺活檢可發現癌細胞。
7、前列腺結石:出現腰骶部、會陰部疼痛、功能障礙、陽痿、早泄等症狀。直腸手指檢查可以接觸到前列腺有結石摩擦感，骨盆x線平片有陽性結石的影子，可以進行資格鑑定。
8、前列腺結核。症狀類似前列腺炎，但有結核病史。直腸是指前列腺呈不規則結節狀，睾丸腫大變硬，輸精管有串珠狀硬結。前列腺液結核桿菌可直接塗片或結核桿菌培養找到結核桿菌，前列腺活體組織檢查可見結核結節或幹酶樣壞死。
