腸息肉主要是手術治療，由於息肉容易癌變，所以主張手術切除。暫不行手術切除者，建議每3~6個月複查腸鏡。
一、一般治療
1、禁食：術前至少空腹8小時，口服瀉藥排便，清空腸道以免影響視野。
2、對症處理：如有出血，給予止血，並根據出血量多少進行相應處置。
二、藥物治療
1、對症治療：有便祕口服乳果糖，有腹瀉口服益生菌、蒙脫石散。
2、病因治療：潰瘍性結腸炎導致的炎性息肉參見潰瘍性結腸炎的治療，使用柳氮磺吡啶或者免疫抑制劑。
3、預防治療：家族性腺瘤性息肉病患者可服用塞來昔布減少腺瘤性結直腸息肉數目，每日兩次，與食物同服。
三、手術治療
1、經腹和直腸切除：絕大多數結直腸息肉不需要進行開腹手術，在結腸鏡下就可以切除。如果患者的息肉爲罕見的遺傳性綜合徵，如家族腺瘤性息肉病，需要開腹進行手術切除結腸和直腸。
2、內鏡下黏膜切除術：該手術是一種在結腸鏡下對無蒂的、平坦的息肉或早期癌症進行切除的新技術。它通過往黏膜下層注射液體(甘油果糖+腎上腺素+亞甲藍)，將息肉擡起，然後用圈套器將息肉完整圈除。
3、黏膜剝離術：對於直徑大於2cm且需一次性切除病變、擡舉徵陰性的腺瘤及部分早癌、內鏡下黏膜切除術殘留或復發治療困難者，可以實行黏膜剝離術治療。黏膜剝離術是一種新型的治療結直腸巨大息肉的方法，它通過在病變下方的黏膜下層注射液體(甘油果糖+腎上腺素+亞甲藍)，將病變擡高，然後用IT刀或Flex刀在病變的周圍和底部逐漸切割，最後將病變完整切除。
4、高頻電切除術：可選擇內鏡下高頻電切除術，對消化道的息肉進行摘除。
四、中醫治療
中醫對於大腸息肉症狀的治療有明顯的效果，在中醫裏，可分爲腸道溼熱、溼瘀阻滯、氣滯血瘀、脾虛夾瘀四種症候類型，可予行氣化溼、活血止痛、清熱利溼、等藥物，但中醫治療需遵循辨證論治的原則，因人而異，需找專業醫師指導治療。
