由於飲食狀況、酸鹼度、胃內容物的性質，服藥和吃飯時間的順序非常講究，會影響療效。
胃腸道反應是紅黴素常見的不良反應，嚴重者可引起胃潰瘍和胃出血，因此醫囑"飯後服用"。但也有人誤解"飯後服用"一放下飯碗就服紅黴素。事實上，飯後立即服藥，藥物不能通過胃迅速進入小腸，影響藥物的溶解度。"飯後服用"一般飯後1~2小時服用，因爲此時大部分胃排空，少量食物會稀釋部分紅黴素，不僅緩解對胃粘膜的刺激，還能使紅黴素迅速進入小腸吸收。
口服紅黴素片有紅黴素鹼糖衣片、琥乙紅黴素和無味紅黴素。現代藥理學認爲，飽餐後立即服紅黴素有如下危害:1．飽餐後食物降低胃的排空速率，延長了藥物在胃內的停留時間，增加了紅黴素在胃中的分解失效。2.飽餐後，食物阻礙紅黴素的正常吸收，因爲食物吸附紅黴素分子，也減少了紅黴素的吸收。3.當食物中的蛋白質與紅黴素共存時，化成二硫化物，從而降低紅黴素的療效。
此外，紅黴素是一種時間依賴性抗生素，半衰期較短。爲了保持血液中有效的殺菌濃度，應每6~8小時服用一次，即每天服用3~4次。紅黴素片應全部服用，不能用手摺斷或咀嚼，否則紅黴素進入胃後立即溶解，容易引起胃潰瘍和胃出血。
