除了在人體內起到維護健康的作用外，實際上，雌激素也在藥用方面起到不小的作用，那麼，雌激素藥物又有哪些呢？
1、口服避孕藥
雌激素會產生負回饋，減少循環中FSH和LH的濃度。大多數的避孕藥都含有合成的雌激素，通常會加上合成的黃體素。 男性體內的使LH濃度減少的負回饋也是由雌二醇產生，並非睾酮。
2、賀爾蒙補充療法
有越來越多的文章討論赫爾蒙療法，給予更年期婦女雌激素跟其他激素來預防骨質酥鬆症和其他的更年期症狀，如熱潮紅、陰道乾澀、壓力性尿失禁、怕冷、頭暈、疲勞、煩躁、出汗等。對於更年期開始後三年內開始服用雌激素5-10年的女性，可以減少50-70％脊椎，手腕，臀部骨折，還有增加脊椎骨密度約5%。
3、乳癌
大約80%的乳癌患者，一旦形成乳癌，它們需要靠雌激素生長，被稱爲激素敏感型或激素受體陽性的癌症。切掉體內雌激素的合成可以治療乳癌。 最近，研究者發現常見的蘑菇有抑制芳香酶的特性，或許可以用來抑制雌激素。在美國已經開始做臨牀試驗，想知道常見的蘑菇是否可以預防乳癌。最近的一項研究已經強調了這項學術研究的重要性。2009年有一份關於2018位女性飲食習慣的病例對照研究指出，有吃蘑菇的女性乳癌的發病率降低了50%。另一項研究發現，食用蘑菇和喝綠茶的中國女性，她們的乳癌發生率降低了90%。 激素受體陽性的乳癌可以用抑制雌激素生成的藥物治療。
4、前列腺癌
在某些情況下，雌激素可以用來治療前列腺癌。
5、其他刺激性藥物
在人類和小鼠，雌激素會促進傷口癒合。 雌激素曾經拿來幫助長得過高的女性，減緩生長速度。 最近在進行的實驗有用雌激素來治療有暴食症的患者，這種疾病可能跟大腦中的賀爾蒙失調有關。 另外，也有研究指出雌激素是個有效的藥物用於治療外傷性肝損傷。
