目前HGV感染的實驗室診斷主要是運用反轉錄聚合酶鏈反應法(RT-pCR)，來檢測血清中HGVRNA以及用酶聯免疫試驗(EIA)檢測血清中抗-HGV抗體。人或動物感染庚型肝炎病毒後約1周左右，血清中可檢測到HGVRNA，一般於感染3周才出現抗-HGV抗體陽性。因此，RT-pCR法可作為庚型肝炎病毒感染的早期診斷。國外報道EIA法與RT-pCR法的陽性符合率僅為3%～18%，不宜作為HGV感染的實驗室診斷。但最近我國自行研製的抗-HGVEIA法與RT-pCR法的陽性符合率可高達60%，可望用於HGV感染的篩查。
